圖書室於民國 80 年 7 月成立，民國 90 年由台北榮總經營管理，民國 97 年 1 月 1 日起改制為國立陽明大學附設醫院圖書室，民國 110 年 2 月 1 日陽明大學與交通大學併校後，改稱為國立陽明交通大學附設醫院圖書室。
配合本院「 結合大學致力創新研究，提供多元人本醫學教育，增進社區與全人類健康 」之宗旨，以支援醫學研究及繼續教育為目標，並且積極朝教學醫學中心的發展方向努力，建立醫學特色館藏，提供多元化、專業化與效率化之圖書資訊服務。
圖書室設有專職人員負責圖書、期刊之採購、分類編目、流通閱覽及參考服務等，館藏方面，中、西文圖書近 6,500 冊，期刊 252 種，並可經由網路使用校圖書館提供之電子期刊、電子書及資料庫多種電子資源。期許未來積極朝圖書館合作資源共享努力，使全體醫護及行政人員在良好的圖書資訊環境之下學習、研究與成長，提昇資訊素養及終身學習之能力。
